Quy định mới về Điều chỉnh trách nhiệm tiếp nhận và giải quyết hồ sơ hoàn thuế từ 14/10/2025

Theo đó, khoản 2 Điều 27 Thông tư 80/2021/TT-BTC về trách nhiệm tiếp nhận và giải quyết hồ sơ hoàn thuế theo quy định của pháp luật về thuế được Thông tư 94/2025/TT-BTC sửa đổi, bổ sung như sau:

1 - Cơ quan thuế quản lý trực tiếp có trách nhiệm tiếp nhận và giải quyết hồ sơ hoàn thuế nêu tại khoản 1 Điều 27 Thông tư 80/2021/TT-BTC  (trừ trường hợp quy định tại (2)).

2 - Cục Thuế tỉnh, thành phố nơi người nộp thuế khai thuế giá trị gia tăng của dự án đầu tư theo quy định tại điểm a khoản 1 Điều 11 Nghị định số 126/2020/NĐ-CP có trách nhiệm tiếp nhận và giải quyết hồ sơ hoàn thuế đối với dự án đầu tư của người nộp thuế.

3 - Cơ quan thuế quản lý trực tiếp có trách nhiệm tiếp nhận và giải quyết hồ sơ hoàn thuế giá trị gia tăng đầu vào chưa được khấu trừ hết của cơ sở kinh doanh khi giải thể, phá sản.

Quy định cũ trước đây tại khoản 2 Điều 27 Thông tư số 80/2021/TT-BTC:

 “2. Cơ quan thuế quản lý trực tiếp người nộp thuế có trách nhiệm tiếp nhận và giải quyết hồ sơ hoàn thuế theo quy định của pháp luật về thuế.”

Như vậy, Thông tư 94/2025/TT-BTC đã làm rõ thẩm quyền giải quyết hồ sơ hoàn thuế, tránh chồng chéo giữa các cấp thuế.

Việc hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư do Cục Thuế tỉnh/thành phố nơi khai thuế dự án đầu tư chịu trách nhiệm tiếp nhận, giải quyết. Trước đây chưa có quy định riêng.

Bên cạnh đó, bổ sung rõ trách nhiệm của cơ quan thuế quản lý trực tiếp đối với hoàn thuế GTGT đầu vào chưa khấu trừ hết khi giải thể, phá sản

Ngoài ra, tổ chức bộ máy ngành Thuế theo quy định mới phù hợp với mô hình mới: “Thuế cơ sở” và “Thuế tỉnh/thành phố” đáp ứng yêu cầu cải cách bộ máy ngành Thuế theo